在光合作用研究中，紙層析是分離和鑒定植物光合色素的常用方法。根據題目描述，采用相同方法提取某植物和菠菜的光合色素，并進行紙層析比較。實驗結果發現，與菠菜相比，該植物缺少距層析起點最近的一條色素帶。

在紙層析實驗中，色素的遷移距離與其極性和溶解度相關。通常，光合色素在層析圖譜上從起點到前沿的排列順序為：胡蘿卜素（橙黃色）、葉黃素（黃色）、葉綠素a（藍綠色）、葉綠素b（黃綠色）。距離起點最近的色素帶是胡蘿卜素，因其極性最小，在層析液中溶解度最大，遷移速度最快。

根據該植物缺少距起點最近的色素帶這一現象，可以初步推測該植物缺少的是胡蘿卜素，其顏色為橙黃色。因此，正確答案應為C選項。

這一實驗結果提示該植物可能在色素合成途徑中存在缺陷，或是其光合系統具有特殊性。胡蘿卜素作為光合作用的輔助色素，能夠吸收并傳遞光能，同時在光保護中起重要作用。缺少胡蘿卜素可能會影響該植物的光合效率和對強光的適應能力。